在流行病隔离期间不向员工支付工资是违法的。被隔离人员有工作单位的，工作单位在隔离期间不得停止支付工作报酬。

法律依据：《中华人民共和国传染病防治法》第四十一条甲类传染病发生地的县级以上地方人民政府或者当地特定区域的人员可以实施隔离措施，并同时向上一级人民政府报告；上级人民政府接到报告后，应当立即作出批准或者不批准的决定。上级人民政府作出不批准决定的，实施隔离措施的人民政府应当立即解除隔离措施。

隔离期间，实施隔离措施的人民政府应当为被隔离人员提供生活保障；被隔离人员有工作单位的，在隔离期间，工作单位不得停止支付工作报酬。

隔离措施的解除由原决策机关决定并公布。

特邀律师：

游山律师

广东深圳

尤姗姗律师自律师执业以来，承办过各种案件，具有丰富的律师经验，熟练的律师法律执业技能，掌握国家法律、法规、行政规章和部门规章的应用。广博的知识、扎实的法律知识、全面的业务、较强的实际应用能力、丰富的实践经验和熟练的谈判技巧。