违章建筑的买卖合同在法律上是有效的。虽然违章建筑违反了行政性法律法规的规定，具有先天的违法性，但订立的违法建筑买卖合同并不违反法律、行政法规的强制性规定，因此不应为无效合同。

　　物权行为理论中的区分原则明确指出，发生物权变动时，应将物权变动的原因与结果作为两个法律事实进行区分，他们的成立生效依据不同的法律根据。根据这一原则，涉违章建筑的合同应当被视为有效合同，因为合同本身的合法性并不取决于标的物是否合法或处分行为能否履行。

　　此外，《中华人民共和国合同法》第44条规定，依法成立的合同自成立时生效。这意味着即使涉及违章建筑，合同也应自成立时生效，其有效性并不依赖于标的物的合法性。同时，《中华人民共和国合同法》第52条提到的导致合同无效的情形，主要针对的是合同双方当事人的意思表示或约定的权利义务是否违反该条款，而非审查标的物。

　　在实际操作中，法院对违法建筑买卖合同的效力问题存在不同观点。一些法院认为，违法建筑买卖合同并未违反效力性规范，因此不应认定为无效。而其他法院则主张，原则上应当认为买卖违法建筑的合同是无效的，但在当事人能够消除建筑物的违法性时，以违法建筑物为标的物的买卖合同有效也是可以的。

　　综上所述，违章建筑的买卖合同在法律上是有效的，但具体情况还需根据案件的具体细节和相关法律法规进行综合判断。在处理此类合同时，建议咨询专业律师以获取准确的法律意见。